Die zweite Vorsorgeuntersuchung zwischen dem dritten und zehnten Lebenstag (U2) ist die sogenannte Neugeborenen-Basisuntersuchung. Ist das Kind noch mit der Mutter im Krankenhaus, wird es von den dortigen Kinderärztinnen oder -ärzten untersucht. Ansonsten werden die Untersuchungen in einer Kinderarztpraxis durchgeführt. Werdende Eltern kümmern sich am besten schon vor der Geburt um eine geeignete Ärztin oder einen Arzt, die oder der auch Hausbesuche macht. Adressen von Kinderarztpraxen bekommen Eltern außer im Internet oder im Branchenbuch beim Gesundheitsamt, bei der Ärztekammer oder von der Hebamme.

Bei der U2 wird das Neugeborene wie bei der U1 gemessen und gewogen. Die Ärztin oder der Arzt untersucht, ob die Organe, Knochen und Gelenke normal funktionieren und es keine Fehlbildungen gibt. Neugeborenen-Reflexe wie Greif- oder Saugreflex werden getestet, und es wird ein Stoffwechseltest durchgeführt. Die Ärztin oder der Arzt fragt nach dem Schlaf- und Trinkverhalten sowie nach der Verdauung des Säuglings. Die Eltern werden außerdem über Vorbeugemaßnahmen (Prophylaxe) wie die Gabe von Vitamin K, D oder Fluorid sowie über das Impfen informiert. 

Die U2 ist für viele Eltern die beste Gelegenheit, offene Fragen zu klären und Unsicherheiten im Umgang mit dem Kind abzubauen. Aus diesem Grund nehmen sich die meisten Kinderärztinnen und -ärzte viel Zeit für diesen Termin.

Seit 2011 wird Eltern das sogenannte erweiterte Neugeborenen-Screening angeboten. Es handelt sich um einen Test, der (seltene) angeborene Stoffwechselerkrankungen und hormonelle Störungen erkennt, die bei Neugeborenen ohne rechtzeitige Behandlung zu körperlichen und geistigen Schäden führen können. Dafür werden dem Säugling am zweiten oder dritten Lebenstag (36 bis 72 Stunden nach der Geburt) einige Blutstropfen aus der Vene oder Ferse entnommen und in einem Labor untersucht. Die Blutentnahme kann mit der zweiten Vorsorgeuntersuchung, der U2, gekoppelt werden. Falls sich Hinweise auf eine Erkrankung ergeben, folgen weitere Untersuchungen oder eine Behandlung.

Die Untersuchung ist freiwillig, die Kosten werden von den gesetzlichen Krankenkassen übernommen.

Hörstörungen sind die häufigste Sinnesbehinderung bei Neugeborenen. In Deutschland werden pro Jahr rund 1500 Babys mit einer behandlungsbedürftigen Hörschädigung geboren. Deshalb wird für alle Säuglinge in den ersten Tagen nach der Geburt das sogenannte Neugeborenen-Hörscreening angeboten. Es handelt sich um einen Test, der in der Geburtsklinik oder in der kinderärztlichen Praxis durchgeführt werden kann. 

Bei dem Test wird geprüft, ob Nervenimpulse aus dem Innenohr an das Gehirn weitergeleitet und verarbeitet werden. So lassen sich angeborene Hörstörungen frühzeitig erkennen und möglicherweise behandeln. Der Test wird am besten durchgeführt, wenn das Baby schläft oder ganz entspannt ist. Er ist schmerzfrei und ohne schädliche Nebenwirkungen. 

Bei einem auffälligen Ergebnis muss der Test möglichst schnell wiederholt werden. Bestätigt sich das Ergebnis, sollte innerhalb der nächsten vier Wochen das Hörsystem des Säuglings in einer qualifizierten Einrichtung (für Phoniatrie und Pädaudiologie) untersucht werden. 

Die Teilnahme am Neugeborenen-Hörscreening ist freiwillig und kostenlos.

Die U3 wird in der vierten bis fünften Lebenswoche vorgenommen. Dabei werden Größe, Gewicht sowie die Bewegungs- und Reaktionsfähigkeit geprüft: Nimmt das Kind ausreichend zu, wird es richtig ernährt, reagiert es auf äußere Reize, kann es Kopf und Körper altersgemäß drehen? Auch die Hüftgelenke, das Gehör, Augenreaktionen und die Fähigkeit, Laute zu bilden, werden kontrolliert. Zudem bekommt das Baby bei dieser Untersuchung die letzte Vitamin-K-Gabe.

Im Rahmen der U3 wird noch einmal über notwendige Impfungen, über Unfallverhütung sowie über Möglichkeiten informiert, dem plötzlichen Kindstod vorzubeugen.

Vor dem Besuch in der Kinderarztpraxis ist es sinnvoll, alle Fragen, die mit der Ärztin oder dem Arzt besprochen werden sollen, aufzuschreiben und die Fragenliste mitzunehmen. Hilfreich ist auch, ein Babytagebuch zu führen, in das die Eltern ab der Geburt ihres Kindes ihre wichtigsten Beobachtungen und Fragen zu seinem Verhalten oder zur Babypflege notieren.